虽说海运航道四通八达是其优势所在，但随着外贸运输的兴起、繁荣，水路交通也变的拥堵起来，其中最为明显的是港口拥堵。是什么原因导致海运港口拥堵？
不可否认，船舶大型化是造成港口拥堵的一个原因。但是所谓的大型船舶（容量在10000标箱以上的船）不应该为世界各地的港口拥堵问题负全部责任。某些港口拥堵显然是许多因素综合发生作用的结果。这些因素在各个国家、港口和码头的存在与严重程度各不相同。
今年5月世界航运理事会（WSC）公布的一份美西港口拥堵报告中，世界航运理事会就船型升级和班轮联盟导致港口拥堵的质疑做出明确回答，称：导致港口拥堵的主要原因包括码头工人数量不足、码头生产率低下、港铁联运及港路联运的基础设施不足及多式联运网络拥堵等。报告指出，港口基础设施不足是导致港口拥堵的重要原因，包括操作设备短缺、操作时间不足和存储空间不足都会导致港口发生拥堵。世界航运理事会称，集装箱船的船型一直在升级，而超大型集装箱船目前仅部署在亚洲-欧洲航线，而非跨太平洋航线，欧洲的港口并未遭受到类似美西港口的拥堵问题。报告同时指出，超大型集装箱船仅占全球运力的不到10%，绝大多数并不挂靠美国港口，在挂靠美国港口的集装箱船中，12000TEU以上的大船所占比例极小。
物流巴巴总结出造成港口拥堵的原因有以下几个：
1、船舶大型化
2、码头工人数量不足
3、码头生产率低下
4、港铁联运及港路联运的基础设施不足
5、多式联运网络拥堵
针对此前码头运营商呼吁美国联邦海事委员会（FMC）就船舶准班率和班轮联盟是否会导致港口拥堵进行调查一事，世界航运理事会给出回答，船型大小和准班率绝对无关，而班轮联盟能够提高班轮公司的船舶运力利用效率。
解决港口拥堵的方法
港口拥堵表现在货物积压、压船压港、港口基础设施不足致周转不畅等。从各家媒体的报道中了解到，港口拥堵已变成一个世界范围共同存在的问题。一些国际集装箱运输专家认为，传统的解决港口拥堵问题的办法，如更新和扩大港口码头基础设施，修建更多的铁路、公路和水运线路等，需要大量的资金投入和时间成本。如果通过信息技术优化管理运力和运输服务来解决港口拥堵问题，将不失为投资少、见效快的较好办法。
和道路畅通有序，才能让保障城市发展有序一样，港口通畅对远洋贸易运输同样重要。为了解决港口物流运输拥堵问题，最好的解决方法是多式联运。
多式联运是指由两种以上的交通工具相互衔接、转运而共同完成的运输过程，其中必须有海上运输方式。多式联运也叫复合运输。多式联运具有以下优势：
A、实现门到门运输。以集装箱为运输单元的多式联运可以提高运作效率，实现门到门运输，在运输途中不需要换箱、装箱，可以减少中间环节及换装可能带来的货物损坏。
B、缩短运输时间、降低运输成本、提高服务质量。多式联运采用一次托运、一次付费、一单到底、统一理赔、全程负责的运输业务方法，这可以大大简化运输与结算手续，提高运输管理水平，最大限度的发挥现有的设备的作用，选择最佳运输路线，组织合理化运输。
物流巴巴多式联运可以降低运输成本，节约运杂费用，一是由于多式联运全程运输采用一张单证，实行单一费率，从而简化了制单和结算的手续，节约了货方的人力、物力，二是通过对运输路线的合理选择和运输方式的合理使用，可以降低全程运输成本，提高利润。
以港口来说，要实施“多式联运”，如海空联运，海陆联运，海铁联运等，在基础设施上就需做好保障，只有基础设施完备，才能实现联运。发展港口多式联运，同时推进港口公路、铁路货站及飞机场地等的建设，一方面促进港口规模建设，有助于港口做大做强，另一方面道路宽了，海陆空铁四线通了，货物运输路线多样了，能从实际上解决拥堵问题。
